实时荧光定量PCR仪100和500的区别主要在于其检测通量和精度。实时荧光定量PCR仪500的检测通量更高，可以实现多通道检测，一次可以检测更多的样品，适合高通量检测实验。

而实时荧光定量PCR仪100的精度更高，更适合对精度要求较高的实验，如基因表达量差异较小或基因拷贝数较低的检测。

此外，实时荧光定量PCR仪500的价格相对较高，适合预算较为充足的实验室。总之，选择哪种实时荧光定量PCR仪需要根据实验需求和预算进行综合考虑。