一般来说，深圳银行公积金部门周末不会上班。但是，可能会有一些特殊情况，比如最后几天是交款截止日期，或者有一些紧急问题需要处理等等，可能会导致部分员工需要上班。如果您需要前往银行公积金部门办理业务，最好提前确认一下当天是否营业，以避免不必要的麻烦。