首先柑橘黄龙病发病后，初期典型症状是在浓绿的树冠中发生1-2条或多条的枝梢发黄，硬化，无光泽，叶脉肿突，黄梢下部的老叶仍呈正常绿色。中后期，当年发黄的黄梢至秋末时，病叶陆续脱落，到次年春萌发前全部落光。

新梢短而弱，病叶细长，主、侧脉绿色，其余部分为淡黄色或黄色。新梢由上而下陆续出现均匀黄化或斑驳症状，随着病害进一步扩展，长出的新梢日渐细小，在病枝上常见脱了叶的新梢，最后全株的枝条都表现症状。病树开花早，花多，病果小，出现畸形果、“青皮果”、“红肩果”等。

而柑橘黄化的起因一般分为生理性黄化和病虫害引起的黄化。生理性黄化的起因主要有缺素黄化、肥害、积水、高温因素造成的黄化等。果农们可通过土壤杀菌、改良土壤环境、修剪、喷叶面肥等一些列措施矫正。

此外病虫害是果树黄化的另一大主因，尤其是为害频发的柑橘根线虫。受到柑橘根线虫危害的病株，叶片和叶脉先是出现黄化，病株生长衰弱，结果小且少，后会逐渐衰退、萎蔫，甚至是枯萎而死。