是的，律师在被恶意投诉的情况下可以选择起诉。法律规定严禁恶意诽谤和陷害他人，如果律师能够证明投诉人出于恶意或者不实的原因而对其进行恶意投诉，律师可以选择向法院提起诉讼维护自身的合法权益。但是，为了避免时间和精力的浪费，律师应该在起诉前充分了解其证据是否足够，并且进行全面评估。