主要原因有两个：

1、新三板准入门槛相对较高。新三板分为三个层次：基础层、创新层和精选层，投资者进行开户的条件为：前10个交易日证券账户及资金账户内的资产日均不低于50万元、100万元、200万元人民币，并具有2年以上证券、基金、期货投资经历，市场上大部分投资不能满足此条件，从而导致交易较少。

2、新三板精选层首日不设涨跌停限制，之后涨跌幅限制为30％，其风险性、收益性相对较大。一旦投资者卖错方向，在当天可能会出现巨亏的情况，从而导致在新三板市场上交易的投资者较少。