胜诉后多得到的工程款应该按照合同约定和法律规定进行处理。首先，应该将多得到的款项进行登记并记录在账簿中，同时将其与原来的合同款项进行区分。

其次，应该按照国家税收政策进行纳税，将应纳税额度计入成本，并在纳税时申报合理的税务抵扣。

最后，应该按照公司的内部管理规定进行审批和核算，确保多得到的款项能够合理使用并为公司创造更多的价值。