《沙丘2》紧随上一部剧情发展，保罗成为了寇伊维恩行星上的圣战士，并将成为世界的领袖。然而，他的权力得到了不同方面的质疑。同时，外星势力也开始侵入人类的世界，寇伊维恩行星变得更加危险。作为反对者的人类联盟不得不考虑与这些新威胁合作。

保罗和他的家人面临了更多的试炼，在权力和生存之间必须作出艰难的抉择。