太阳系真实运行轨迹图是在16世纪由天文学家约翰·开普勒发现的。他通过长期观测行星运动，提出了三大行星定律，揭示了行星在椭圆轨道上运动的规律，并且发现了太阳系内行星运动的轨迹不是圆形的，而是椭圆形的。他的发现极大地促进了科学对天体运动轨迹和行星运动规律的研究和理解，奠定了现代天文学的基础。