中证A50和上证A50有以下区别：

- 编制方不同：中证A50指数是由中国证券市场的国内机构——中证指数有限公司编制；上证50指数是由上海证券交易所编制。

- 成分股不同：中证A50指数选取50只各行业市值最大的作为样本股，共覆盖30个二级行业以及50个三级行业，都是市值最大的公司；上证50指数是从上海交易所里挑选规模最大、流动性最好的50支股票组成，只代表上海市场的超大盘股的整体状况。

- 交易时间不同：中证A50指数的交易时间段是9:00-16:30和17:00-次日02：00；上证50指数的交易时间段是上午9：30到11：30，下午13：00到15：00。