根据相关报道，南昌方大特钢与当地环保部门之间存在多次环境违法行为的纠纷。2019年，该公司被曝光存在废气治理不到位、废水排放浓度超标等问题。2020年初，经多轮督查，南昌市出台了关于方大特钢限产整治工作的通知，要求该公司严格实施环保手续、改善环境污染等。因此，可以认为南昌方大特钢曾存在严重的环境污染问题，但目前正在通过整治措施改善。