福建出生证明超过一年仍然可以办理。但需要注意的是，如果时间超过一年，可能需要提供孩子和母亲之间的亲子鉴定证明后才可以办理出生证明。

办理出生证明的具体流程可能因地区和医院而有所不同，一般需要到医院指定的地方办理，有的可能需要开具亲子证明才能办理。因此，建议尽早在医院规定的有效期内办理出生证明，以避免不必要的麻烦。

出生证明对于孩子的上户口、办理社保卡等事项都是必要的，所以请根据个人情况，尽早安排时间办理。