巨型石斑鱼有天敌，其中最主要的天敌是人类。由于巨型石斑鱼肉质鲜美，因此常被捕捞作为人类的食物。其他的天敌包括李氏鲷、猫头鹰鱼等大型鱼类和一些鲨鱼种类。不过，由于巨型石斑鱼很大，而且身体非常结实，因此很难被天敌攻击致死，它们的天敌压力相对较小。