在4月~5月上旬采挖出土的肉苁蓉，质量是最好的。秋季也会有少量的肉苁蓉出土，但是数量很少。肉苁蓉在采挖时要尽量保证其完整性。肉苁蓉在采挖收获时候要选择与寄主连接的外围挖坑到肉苁蓉的底部，这样可以减少寄主植物有所损伤。