南通专卖店是否为直营店需要根据具体情况来判断。如果南通专卖店是由品牌公司直接经营或者授权给特定企业经营的，那么它就是直营店；如果南通专卖店是由独立经营者开设并经营，只是销售品牌公司产品，那么它就是加盟店。因此，需要查阅南通专卖店的经营方式和品牌授权情况，才能准确判断它是直营店还是加盟店。