挖出甲鱼的方法有以下几种：
徒手抓捕：当需要量小时，可以穿水裤进入水池，用脚踩甲鱼，或用手抓住甲鱼。抓甲鱼时，用食指和拇指将甲鱼下半身粘住，插入泥沙中，防止逃脱。当甲鱼不再钻入泥和沙中时，可以用两根手指卡在甲鱼的后腿和腋窝下，将它们从水中抓出来。不要抓住甲鱼的前部，以免甲鱼的头伸出来咬人。如果被甲鱼咬伤，必须迅速把甲鱼和手放进水里，甲鱼会松开嘴逃跑。
使用老鳖叉：老鳖叉是一段带有倒钩的工具，另一端带有四个叉。捉甲鱼时，在水中行走，一边用老鳖叉往下刺探，当感觉碰到硬硬的东西，就是甲鱼壳。此时只要用脚踩住，再用倒钩那一端勾住甲鱼的鳖裙，一提就可以出水。
干池捕捞：排干池水，将甲鱼全部捕起。少数钻入泥中的甲鱼，可以在夜间等它爬上岸时，用手电筒照捕。人工养殖的外塘甲鱼起捕时间一般在秋末冬初，水温10～15℃时，捕捞和运输都容易，造成的伤害少，也便于选择后备亲鳖。