豪爵铃木DL250的三箱版和自己配铝合金的各有优缺点，具体选择哪种方式，取决于你的个人需求和预算。

三箱版的优点在于厂家已经为你配好了三箱，不需要自己再费心去选择和购买，同时三箱版的外观设计比较协调，整体看起来更加美观。另外，三箱版的三箱一般都是经过特殊设计的，可以更好地保护摩托车和货物，具有更好的防盗性和防水性。

自己配铝合金的优点在于可以根据自己的需求和预算选择更加合适的铝合金箱子，同时可以根据自己的喜好进行个性化定制，让摩托车更加符合自己的审美。此外，自己配铝合金的箱子也可以更好地适应不同的骑行场景，比如长途骑行或者越野骑行等。

总的来说，如果你比较注重外观和便捷性，可以选择三箱版；如果你比较注重个性化和实用性，可以选择自己配铝合金的箱子。不过需要注意的是，无论选择哪种方式，都需要确保箱子的质量和安装的安全性，以确保骑行的安全和舒适。