在《灵境行者》这部小说中，主角张元清的头疼病是由于他的灵魂受到了伤害所导致的。这个情节在小说中有着重要的意义，它揭示了主角的内心痛苦和过去经历的阴影。同时，也通过主角的头疼病，展现了他在面对困难和挑战时所承受的压力和挣扎。

具体来说，主角的头疼病是因为他在灵境中的一次意外事故中受到了灵魂伤害。在灵境中，他需要面对各种危险和考验，而这次事故导致他的灵魂受到了重创，从而引发了头疼病。这个情节不仅揭示了主角内心的痛苦和挣扎，也展现了他在面对困难和挑战时所做出的牺牲和努力。

总之，在《灵境行者》这部小说中，主角的头疼病是因为他的灵魂受到了伤害所导致的。这个情节不仅揭示了主角的内心痛苦和过去经历的阴影，也展现了他在面对困难和挑战时所做出的牺牲和努力。