京东小店代付功能需要在京东小店的后台中申请开通，具体操作方法如下：首先登录京东商家后台，进入“店铺装修”页面，在“店铺设置”中找到“代付管理”功能，点击“开通代付”按钮，并按照要求填写相关信息即可。

开通代付后，客户将可以使用代付功能进行下单支付，商家也可以通过代付功能管理订单和退款等操作。建议商家在正式使用前仔细阅读相关规定，以确保正常使用。