子系统可以申请软件著作权登记。子系统是指在一个大型软件系统中，由若干个模块组成的一个独立的子集，可以独立运行且具有明确的功能和特定的接口。子系统中的软件代码通常都是由固定的开发团队开发的，因此可以被视为独立的软件作品。