方法有多种，如农杆菌质粒介导法（包括Ti质粒的Ri质粒）、植物病毒载体介导法、DNA直接导入法（包括PEG介导、脂质体介导等化学诱导DNA直接转化法，电激法、超声波、显微注射、激光微束、基因枪法等物理诱导DNA直接转化法等）和种质系统介导基因转化法（包括花粉管导入法，生殖细胞浸泡法，囊胚、子房注射法等）