因为飞行员在夜间飞行的时候，即使经验非常充足，而且对于航线也非常熟悉，事实上，也有可能会因为夜里的天气原因等一些情况，导致看不清楚的现象出现，这样一来，飞机的起落也就自然会存在一定的安全隐患了。

此外，研究也发现，夜间飞行对于飞行员来说，他们的精力、决断能力等情况，也都要比白天飞行的时候差，特别是突然出现意外情况的时候，也是有可能会出现反应不过来的情况，这也是属于安全隐患的一种。

再加上并不是所有的机场，都为了“红眼航班”的到来做足了充分的准备，特别是机场夜间的硬件设置上，因此，一旦机场夜间设施方面也是存在着不足，同样也会出现安全隐患，所以，诸多因素加在一起，也就成了“红眼航班”并没有那么安全的原因。