综合计算工时制是以周、月、季、年等为周期，对员工的工作日和休息日进行综合计算的一种工时制度。这种工时制度主要针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工。实行综合工时需要获得政府部门的审批。

在具体的计算中，如果在一个综合计算周期内的实际工作时间超过法定的标准工作时间，则认定为加班。例如，采用月综合工时制度的情况下，当月的总工时超过了核定的标准时间，就被视为加班。此时，应支付不低于工资150％的工资报酬；法定节假日工作的，算加班，支付不低于工资的300％的工资报酬。