区别主要有以下几点：

缴费基数不同：机关事业单位和国有企业原则上都是按国家统一要求的社保缴费基数规定缴纳社保的。但是很多的私营企业单位为了省钱，选择最低缴费基数给职工缴纳社保。

缴费比例不同：事业单位一般是按照实际的福利待遇确定缴费基数，通常会在社平工资的百分之百以上，高的甚至可达150%-200%。而企业参保的人，缴费基数则不是很高，大多是在最低缴费基数60%上下浮动。

退休金构成不同：事业单位退休金由基础养老金、个人账户养老金、过渡性养老金、职业年金四个部分构成；企业退休金则由基础养老金、个人账户养老金、过渡性养老金三个部分构成。