根据不同城市和地区、公证机构的不同，兄弟分房产协议公证的费用也会有所不同。一般来说，公证费用包括证书费、鉴证费、服务费等，总体费用相对较低，一般在几百元至数千元之间。但具体费用还需根据当地公证机构的收费标准而定，建议事先咨询机构或公证员了解相关费用及公证流程等信息。

公正的公证可以避免分配过程中的分歧，保证分配的公平性和透明度，是非常值得的费用。