港澳通行证空卡在深圳是可以签注的。如果您是广东省内户籍，可以直接在自助签注机办理签注。如果您是广东省外户籍，且是首次在深圳签注，那么首先需要办理居住证，待居住证办理下来后，在【深圳公安】微信公众号预约前往出入境大厅进行办理。如果您是广东省外户籍，再次在深圳签注，可以直接在自助签注机办理签注，但需要保证居住证在有效期内1。

无论广东省内还是省外的非深户，在深圳办理港澳通行证续签都不需要居住证。如果您的港澳通行证卡片背后一片空白，需要预约去人工窗口签注。如果您的港澳通行证曾经签注过（卡片背后有签注信息），可以去自助机签注