闽南朱候尊王，指的是明朝末年闽南地区的一个抗清抗明复辟的组织和其首领朱一贵。

朱一贵，原名朱科，字尧卿，号一翔，闽南泉州人。朱一贵原为明朝顺天府漕运司正千户，因明朝政治腐败和民众生活困苦，加之1644年明朝灭亡，中国陷入清朝统治之下，朱一贵受到战乱的影响，于1657年起义，率领一批游击队开始抗清斗争。

朱一贵起义后，他自称“中正王”，创立了“闽南尊王府”，成为一个有一定政治组织性质的抗清力量。他在起义初期就积极开展宣传活动，吸引了一大批的支持者。朱一贵并得到了其他地方抗清将领的支持，形成了一支庞大的抗清队伍。他们采取游击战和袭击城镇等方式，对清朝的统治和军队进行了频繁的袭击和骚扰，给清朝造成了很大的困扰。

然而，朱一贵的抗清斗争并没有取得最终的胜利。清朝派遣大军进行镇压，朱一贵的势力逐渐衰弱。最终，朱一贵在1662年被清军围困于闽江岸边的长汀，被迫投降。

朱一贵的抗清斗争虽然失败，但他的事迹和精神对后来的抗清斗争产生了重要影响。闽南地区的抗清力量也因此得到了更多的激发和整合，为日后的抗清斗争奠定了基础。