因为咕咕鸟的习性是单配偶繁殖，通常是一雌一雄，因此只有一只咕咕鸟在窝里孵着蛋是很正常的现象。

咕咕鸟属于单配偶繁殖的鸟类，它们会选择一位配偶，与其长期生活在一起。

一旦配偶死亡，咕咕鸟很难再次找到新的伴侣。

因此，如果只有一只咕咕鸟在窝里孵着蛋，很有可能是因为另一只配偶已经死亡。

此外，咕咕鸟的繁殖季节一般在春季，一年只繁殖一次。

为了保护蛋和幼鸟，只有一只咕咕鸟在窝里孵着蛋也是一种保护措施，以避免多只鸟争抢食物和保护区域。