1.收取款项：首先，需要确定这笔款项的具体来源，并根据与对方公司签订的协议来确定收取的时间。确保收款操作符合双方约定。
2.核实款项：在收到款项后，通过核销现金或其他有效的凭证来验证款项的真实性，确保账目记录与实际收到的款项相符。
3.记账：核对款项无误后，将收支双方的金额、账号等信息准确地登记入账簿中。
4.确认发票：如果收到的款项是通过客户的发票支付的，还需确认发票的真实性和准确性。
5.报税：根据公司与客户之间的协议，支付款项后应对相关的税收进行申报和缴纳。
6.结案：完成收付款项的工作后，及时将账务结清，款项明确归类，并将账务结果汇总，为后续的税务报告和其他财务报表做好准备。
7.编制记账凭证：根据上述过程产生的数据，整理成记账凭证，包括双方的收支明细，并备注具体交易事项。这些凭证可供审计时使用。
8.会计分录：根据记账凭证，运用借贷原则进行记账，以确保往来款的收支得到正确的记录，并在相应的账户上进行登记，便于以后的查验。
9.编制现金流量表：根据记账凭证和已登记的账簿信息，编制现金流量表，以反映公司与公司之间在某一时期的收支状况，并维护公司的财务状况。
10.结账：根据现金流量表进行结账，登记实际的收入或支出，并将结账结果记录在账户上，用于进一步的分析。
以上步骤可以帮助新公司在月底处理往来款，确保财务流程的规范和透明。