预处理：新购的超滤离心管使用前需要用纯水浸泡并置于冰箱预冷10分钟。之后倒出纯水，将超滤管置于冰上预冷2-5分钟。
加样：如超滤管中有少许残留水，可将超滤管内管倒置1000×g离心1分钟，移液枪移取适量样本加入超滤管中。
平衡：质量和重心二者都要达到平衡。注意转速和加速度不可太快，否则直接损坏超滤膜。开始离心超滤（离心机预冷至4度）。不同离心机的转速 rpm换算成g之后，有所不同。具体可阅说明书。离心机的加速度调至最低档，减小对膜的压力。
离心：配平后，以12000 ×g离心（15-30分钟），等达到目的转速后方可离开。使用完的超滤管用纯水反复清洗5次，再用75%乙醇冲洗3次。
注意事项：
超滤管最大离心力不能超过12000g，否则会导致滤膜破损。
超滤样本会损失五分之一至二分之一的样本量，主要取决于样本中蛋白含量。
若管底有可见的蛋白沉淀，可以先加入纯水，然后用枪头吹打，注意不要碰到膜，吹打至沉淀悬起，然后倒掉，不可用自来水猛冲。
这些是基本的使用步骤，但具体的使用可能还需要杭州3K超滤离心管的产品说明书，或者寻求专业人士的帮助。