据了解，高新区灵沼要拆除的村庄包括：

灵沼村、灵沼南村、灵沼北村、灵沼东村、灵沼西村、灵沼中村、灵沼新村、灵沼村委会、灵沼南村委会、灵沼北村委会、灵沼东村委会、灵沼西村委会、灵沼中村委会、灵沼新村委会等。

这些村庄被拆除的原因是为了高新区的城市化建设和发展需要，以及为了改善当地的生态环境和居住条件。

这些村庄大多数是老旧的农村村庄，建筑物老化、设施陈旧，不符合现代城市化建设的要求。

此外，这些村庄周围的环境也存在一些问题，如垃圾堆积、污水排放等，对当地的生态环境造成了一定的影响。

拆除这些村庄的具体操作步骤如下：

1. 制定拆迁计划：

根据高新区的城市化建设和发展需要，制定拆迁计划，确定拆迁范围和拆迁时间。

2. 与村民协商：

与被拆迁的村民进行协商，了解他们的意见和需求，尽可能减少对他们的影响。

3. 安置被拆迁的村民：

为被拆迁的村民提供合适的安置方案，包括住房、就业、教育等方面的安排。

4. 拆除建筑物：

按照拆迁计划，对被拆除的建筑物进行拆除，确保拆除过程中的安全和环保。

5. 处理土地问题：

对拆除后的土地进行处理，包括清理垃圾、填平坑洼等。

6. 建设新的城市化设施：

根据高新区的城市化建设和发展需要，对拆除后的土地进行规划和建设，建设新的城市化设施，提高当地的生活质量和环境质量。