新生儿益生菌是否可以通过医保报销，主要取决于其剂型、药品成分以及医生的处方情况。

一般来说，医保并不覆盖益生菌的费用。但在某些特殊情况下，一些地方医保可能会将其列为特殊报销项目。另外，医院购买的益生菌需要符合相关的规定才可申请报销，因此在购买前需要了解当地的相关政策。

以婴幼儿为例，国家医保目录中可以报销的婴幼儿益生菌药品有4种，分别是婴儿双歧杆菌口服溶液、婴幼儿嗜酸乳杆菌干混悬剂、婴幼儿双歧杆菌颗粒和婴儿双歧杆菌口含片。

因此，关于新生儿益生菌是否可以报销，需要结合具体情况分析。如果想要了解更多关于新生儿益生菌报销的问题，建议咨询当地社保部门或医院相关部门的工作人员。