职工社保断了两个月转灵活社保后，可以补缴。根据社保政策规定，灵活就业参保者只要是跨年断缴的保费，就不可以补缴，除了几种特殊情况以外，任何人跨年断缴的保费都不可以补缴。

具体补缴办法和要求可能因地区而异，建议拨打12333热线或前往当地社保局咨询。