生化棉和羊绒棉都是一种高效的水处理材料，但二者的透水性存在差异。生化棉是以竹炭、活性炭、陶瓷等多种材料构成的多孔性过滤材料，具有良好的透气性和透水性，可促进水中微生物的繁殖及降解有害物质。

而羊绒棉则是羊毛的纤维材料，通过纤维间的微小间隙来过滤水分和杂质，其透水性相比生化棉稍弱。因此，生化棉较适用于大型生态环境修复工程，而羊绒棉适合于水质较好的小型生态景观或鱼缸等场合。