瓜州县和玉门市都是隶属于甘肃省酒泉市的县级行政区，二者的面积大小存在差异。瓜州县的面积为3.2万平方公里，而玉门市的面积为1.5万平方公里。因此，从面积上看，瓜州县要比玉门市大一倍以上。由此可见，瓜州县在面积上占据优势，是甘肃省酒泉市的一个较大的县级行政区。